自6月起，国家林草局将对全国各级各类自然保护地集中开展大检查，其中重点检查国家级自然保护区、国家级风景名胜区、国家级森林公园、国家级湿地公园、国家级地质公园、海洋特别保护区(海洋公园)、自然遗产等。
重点检查的区域包括长江经济带、京津冀、珠三角自然保护地。
“机构改革之后，先对全国自然保护地摸清家底。” 5月27日，林草局保护司相关负责人向澎湃新闻表示，这次大检查也是对全国各类自然保护地底数和管理薄弱环节进行的一次摸底，全面系统排查和预防整治自然保护地内破坏自然资源的违法违规情况，切实加强自然生态系统原真性、完整性、系统性保护，守住生态红线。
国务院机构改革方案明确，以国家公园为主体的各类自然保护地都由林草局负责，但机构改革之前各类保护地管理交叉、重叠，我国保护地底数尚不清楚。
国家林草局保护司巡视员严旬曾在4月份林草局举行的例行发布会上表示，自然资源部地质公园部分已划转到国家林草局，其他部门管理的保护地划转工作还在协调中。
“保护地的数量目前还没有最新的、最权威的数据。” 严旬说，原因在于各保护地都分布在不同的部门，有些还有重叠。他举例说，在原国家林业局内部，保护地就存在重叠的现象，比如一个自然保护区，同时又是一个林场，加挂了一个森林公园的牌子，又挂了一个地质公园的牌子。“像这样的保护地，今后可能要予以明确到底是什么。要通过整合，更加明确、规范，也便于管理。”
5月24日，《国家林业和草原局办公室关于开展全国自然保护地大检查的通知》(简称《通知》)已印发至各省(区、市)林业厅(局)及林草局驻各地森林资源监督机构等部门。
《通知》要求，此次检查将依据自然保护地的法律法规、部门规章、规范性文件等作为依据，重点检查中央领导同志批示处理、中央环保督察、近年来被媒体曝光或群众举报的自然保护地违法违规问题整改进展情况、处理情况。还包括违法违规侵占自然保护地的土地活动，包括开发房地产、探矿采矿，采石挖沙，破坏森林，湿地和野生动物资源，自然保护区核心区缓冲区内旅游开发和水电开发等。
此次检查还将重点对自然保护区管理机构设立、确界立标情况进行检查，对自然保护地底数、现状数据，包括批复情况、管理机构、四至边界、规划图件、各类自然保护地交叉重叠情况等进行摸查。
此次大检查时间持续半年。今年6-7月，各自然保护地管理机构完成自查，编制问题台账;8-9月，各省级林业主管部门会同驻各地森林资源监督机构完成抽查并于9月底前上报;10-12月，国家林草局组织督导组赴各地实地督导。
